Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
XPNPEP3Q9NQH7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XPNPEP3Q9NQH7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
XPNPEP3Q9NQH7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XPNPEP3Q9NQH7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XPNPEP3Q9NQH7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XPNPEP3Q9NQH7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XPNPEP3Q9NQH7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XPNPEP3Q9NQH7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XPNPEP3Q9NQH7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XPNPEP3Q9NQH7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XPNPEP3Q9NQH7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XPNPEP3Q9NQH7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XPNPEP3Q9NQH7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
XPNPEP3Q9NQH7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XPNPEP3Q9NQH7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
XPNPEP3Q9NQH7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XPNPEP3Q9NQH7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XPNPEP3Q9NQH7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms