Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PITPNM3Q9BZ71 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PITPNM3Q9BZ71 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PITPNM3Q9BZ71 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PITPNM3Q9BZ71 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PITPNM3Q9BZ71 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PITPNM3Q9BZ71 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms