Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NIFKQ9BYG3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NIFKQ9BYG3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms