Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RBM42Q9BTD8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RBM42Q9BTD8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RBM42Q9BTD8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RBM42Q9BTD8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RBM42Q9BTD8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RBM42Q9BTD8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RBM42Q9BTD8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RBM42Q9BTD8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RBM42Q9BTD8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
RBM42Q9BTD8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RBM42Q9BTD8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RBM42Q9BTD8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RBM42Q9BTD8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RBM42Q9BTD8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RBM42Q9BTD8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RBM42Q9BTD8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
RBM42Q9BTD8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RBM42Q9BTD8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RBM42Q9BTD8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RBM42Q9BTD8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RBM42Q9BTD8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RBM42Q9BTD8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RBM42Q9BTD8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RBM42Q9BTD8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RBM42Q9BTD8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RBM42Q9BTD8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RBM42Q9BTD8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RBM42Q9BTD8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
RBM42Q9BTD8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RBM42Q9BTD8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RBM42Q9BTD8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RBM42Q9BTD8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
RBM42Q9BTD8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RBM42Q9BTD8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RBM42Q9BTD8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RBM42Q9BTD8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RBM42Q9BTD8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms