Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP6Q9BRS8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP6Q9BRS8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP6Q9BRS8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LARP6Q9BRS8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LARP6Q9BRS8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LARP6Q9BRS8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LARP6Q9BRS8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
LARP6Q9BRS8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LARP6Q9BRS8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LARP6Q9BRS8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LARP6Q9BRS8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LARP6Q9BRS8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LARP6Q9BRS8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LARP6Q9BRS8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LARP6Q9BRS8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LARP6Q9BRS8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LARP6Q9BRS8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LARP6Q9BRS8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LARP6Q9BRS8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LARP6Q9BRS8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LARP6Q9BRS8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LARP6Q9BRS8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LARP6Q9BRS8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LARP6Q9BRS8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LARP6Q9BRS8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LARP6Q9BRS8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LARP6Q9BRS8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LARP6Q9BRS8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms