Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SH2D3AQ9BRG2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH2D3AQ9BRG2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms