Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GORASP1Q9BQQ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms