Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CMSS1Q9BQ75 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms