Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GABRG3Q99928 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABRG3Q99928 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms