Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EIF3CQ99613 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3CQ99613 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
EIF3CQ99613 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF3CQ99613 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF3CQ99613 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF3CQ99613 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF3CQ99613 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF3CQ99613 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms