Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCBPQ99417 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCBPQ99417 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCBPQ99417 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCBPQ99417 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCBPQ99417 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCBPQ99417 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCBPQ99417 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCBPQ99417 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCBPQ99417 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCBPQ99417 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCBPQ99417 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCBPQ99417 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCBPQ99417 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCBPQ99417 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCBPQ99417 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCBPQ99417 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYCBPQ99417 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYCBPQ99417 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYCBPQ99417 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MYCBPQ99417 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYCBPQ99417 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYCBPQ99417 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms