Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NEURL4Q96JN8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NEURL4Q96JN8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NEURL4Q96JN8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NEURL4Q96JN8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
NEURL4Q96JN8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NEURL4Q96JN8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NEURL4Q96JN8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NEURL4Q96JN8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NEURL4Q96JN8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
NEURL4Q96JN8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NEURL4Q96JN8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NEURL4Q96JN8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NEURL4Q96JN8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NEURL4Q96JN8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
NEURL4Q96JN8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NEURL4Q96JN8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NEURL4Q96JN8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NEURL4Q96JN8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NEURL4Q96JN8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NEURL4Q96JN8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
NEURL4Q96JN8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NEURL4Q96JN8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NEURL4Q96JN8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NEURL4Q96JN8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NEURL4Q96JN8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
NEURL4Q96JN8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms