Protein–RNA interactions for Protein: Q96EN9

C19orf60, Uncharacterized protein C19orf60, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf60Q96EN9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C19orf60Q96EN9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C19orf60Q96EN9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms