Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
GCC1Q96CN9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms