Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
TOPBP1Q92547 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
TOPBP1Q92547 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
TOPBP1Q92547 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
TOPBP1Q92547 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
TOPBP1Q92547 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
TOPBP1Q92547 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
TOPBP1Q92547 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
TOPBP1Q92547 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
TOPBP1Q92547 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
TOPBP1Q92547 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
TOPBP1Q92547 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
TOPBP1Q92547 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
TOPBP1Q92547 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
TOPBP1Q92547 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
TOPBP1Q92547 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
TOPBP1Q92547 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
TOPBP1Q92547 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
TOPBP1Q92547 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
TOPBP1Q92547 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
TOPBP1Q92547 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
TOPBP1Q92547 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
TOPBP1Q92547 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
TOPBP1Q92547 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
TOPBP1Q92547 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC40.69■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
TOPBP1Q92547 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
TOPBP1Q92547 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
TOPBP1Q92547 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
TOPBP1Q92547 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
TOPBP1Q92547 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
TOPBP1Q92547 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
TOPBP1Q92547 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
TOPBP1Q92547 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
TOPBP1Q92547 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
TOPBP1Q92547 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC40.6■■■■■ 4.09
TOPBP1Q92547 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
TOPBP1Q92547 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
TOPBP1Q92547 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
TOPBP1Q92547 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
TOPBP1Q92547 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
TOPBP1Q92547 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.09
TOPBP1Q92547 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
TOPBP1Q92547 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
TOPBP1Q92547 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
TOPBP1Q92547 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
TOPBP1Q92547 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
TOPBP1Q92547 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
TOPBP1Q92547 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC40.56■■■■■ 4.08
TOPBP1Q92547 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
TOPBP1Q92547 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
TOPBP1Q92547 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
TOPBP1Q92547 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
TOPBP1Q92547 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC40.53■■■■■ 4.08
TOPBP1Q92547 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
TOPBP1Q92547 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
TOPBP1Q92547 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
TOPBP1Q92547 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
TOPBP1Q92547 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
TOPBP1Q92547 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
TOPBP1Q92547 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
TOPBP1Q92547 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
TOPBP1Q92547 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
TOPBP1Q92547 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
TOPBP1Q92547 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
TOPBP1Q92547 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
TOPBP1Q92547 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms