Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYQ5

DGCR8, Microprocessor complex subunit DGCR8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR8Q8WYQ5 SGK1-221ENST00000525700 541 ntTSL 42.71□□□□□ -1.981e-11■■■■■ 94.4
DGCR8Q8WYQ5 UBE2V1-214ENST00000472923 421 ntTSL 52.61□□□□□ -1.991e-11■■■■■ 94.4
DGCR8Q8WYQ5 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.026e-11■■■■■ 94.4
DGCR8Q8WYQ5 UBE2V1-216ENST00000483534 1155 ntTSL 1 (best)2.34□□□□□ -2.031e-11■■■■■ 94.4
DGCR8Q8WYQ5 SGK1-218ENST00000524387 576 ntTSL 41.98□□□□□ -2.091e-11■■■■■ 94.4
DGCR8Q8WYQ5 UBE2V1-220ENST00000492371 535 ntTSL 31.41□□□□□ -2.181e-11■■■■■ 94.4
DGCR8Q8WYQ5 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.221e-11■■■■■ 94.4
DGCR8Q8WYQ5 SGK1-225ENST00000531575 576 ntTSL 40.83□□□□□ -2.281e-11■■■■■ 94.4
DGCR8Q8WYQ5 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.96□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 94.2
DGCR8Q8WYQ5 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 94.2
DGCR8Q8WYQ5 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.463e-7■■■■■ 94
DGCR8Q8WYQ5 CUX1-202ENST00000292538 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.473e-7■■■■■ 94
DGCR8Q8WYQ5 CUX1-210ENST00000497815 947 ntTSL 211.71□□□□□ -0.533e-7■■■■■ 94
DGCR8Q8WYQ5 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.543e-7■■■■■ 94
DGCR8Q8WYQ5 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.573e-7■■■■■ 94
DGCR8Q8WYQ5 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 94
DGCR8Q8WYQ5 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.773e-7■■■■■ 94
DGCR8Q8WYQ5 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.813e-7■■■■■ 94
DGCR8Q8WYQ5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 93.8
DGCR8Q8WYQ5 EHMT1-205ENST00000462942 7842 ntTSL 211.04□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 93.8
DGCR8Q8WYQ5 EHMT1-237ENST00000637261 4208 ntTSL 510.91□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 93.8
DGCR8Q8WYQ5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.848e-9■■■■■ 93.6
DGCR8Q8WYQ5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.668e-9■■■■■ 93.6
DGCR8Q8WYQ5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.468e-9■■■■■ 93.6
DGCR8Q8WYQ5 NFIX-206ENST00000586797 1615 ntTSL 517.48■□□□□ 0.398e-9■■■■■ 93.6
DGCR8Q8WYQ5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.378e-9■■■■■ 93.6
DGCR8Q8WYQ5 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.038e-9■■■■■ 93.6
DGCR8Q8WYQ5 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.168e-9■■■■■ 93.6
DGCR8Q8WYQ5 NFIX-204ENST00000585382 1083 ntTSL 511.13□□□□□ -0.638e-9■■■■■ 93.6
DGCR8Q8WYQ5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 93.6
DGCR8Q8WYQ5 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 93.6
DGCR8Q8WYQ5 FGF13-205ENST00000441825 1625 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 93.6
DGCR8Q8WYQ5 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.242e-6■■■■■ 93.6
DGCR8Q8WYQ5 FGF13-207ENST00000455663 687 ntTSL 35.48□□□□□ -1.532e-6■■■■■ 93.6
DGCR8Q8WYQ5 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.552e-6■■■■■ 93.6
DGCR8Q8WYQ5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.813e-7■■■■■ 93.5
DGCR8Q8WYQ5 TMEM91-204ENST00000413014 650 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.653e-7■■■■■ 93.5
DGCR8Q8WYQ5 TMEM91-214ENST00000604123 757 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 93.5
DGCR8Q8WYQ5 EHMT1-248ENST00000637891 1930 ntTSL 517.9■□□□□ 0.463e-7■■■■■ 93.3
DGCR8Q8WYQ5 ERGIC1-201ENST00000326654 3952 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.046e-11■■■■■ 93.2
DGCR8Q8WYQ5 MEG9-202ENST00000452349 385 ntTSL 35.39□□□□□ -1.553e-8■■■■■ 92.8
DGCR8Q8WYQ5 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.276e-8■■■■■ 92.8
DGCR8Q8WYQ5 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.153e-7■■■■■ 92.7
DGCR8Q8WYQ5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.964e-12■■■■■ 92.5
DGCR8Q8WYQ5 TMEM56-203ENST00000456991 992 ntTSL 319.16■□□□□ 0.662e-14■■■■■ 92.5
DGCR8Q8WYQ5 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.32e-14■■■■■ 92.5
DGCR8Q8WYQ5 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.362e-14■■■■■ 92.5
DGCR8Q8WYQ5 TMEM56-202ENST00000455656 609 ntTSL 511.04□□□□□ -0.642e-14■■■■■ 92.5
DGCR8Q8WYQ5 AC092802.3-201ENST00000434207 420 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.182e-14■■■■■ 92.5
DGCR8Q8WYQ5 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC5.82□□□□□ -1.485e-93■■■■■ 92.5
DGCR8Q8WYQ5 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.59□□□□□ -2.311e-9■■■■■ 91.9
DGCR8Q8WYQ5 CARS2-213ENST00000537394 720 ntTSL 526.39■■□□□ 1.829e-7■■■■■ 91.8
DGCR8Q8WYQ5 CARS2-227ENST00000542126 567 ntTSL 420.14■□□□□ 0.819e-7■■■■■ 91.8
DGCR8Q8WYQ5 CARS2-215ENST00000537412 570 ntTSL 418.33■□□□□ 0.529e-7■■■■■ 91.8
DGCR8Q8WYQ5 CARS2-222ENST00000540629 531 ntTSL 418.06■□□□□ 0.489e-7■■■■■ 91.8
DGCR8Q8WYQ5 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.169e-7■■■■■ 91.8
DGCR8Q8WYQ5 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.219e-7■■■■■ 91.8
DGCR8Q8WYQ5 CARS2-228ENST00000542709 572 ntTSL 412.04□□□□□ -0.489e-7■■■■■ 91.8
DGCR8Q8WYQ5 CARS2-223ENST00000540785 301 ntTSL 31.87□□□□□ -2.119e-7■■■■■ 91.8
DGCR8Q8WYQ5 CTDSP1-213ENST00000496785 460 ntTSL 518.48■□□□□ 0.558e-11■■■■■ 91.7
DGCR8Q8WYQ5 DLG2-212ENST00000434967 442 ntTSL 310.61□□□□□ -0.718e-11■■■■■ 91.7
DGCR8Q8WYQ5 DLG2-228ENST00000530800 566 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.818e-11■■■■■ 91.7
DGCR8Q8WYQ5 DLG2-224ENST00000529399 559 ntTSL 410□□□□□ -0.818e-11■■■■■ 91.7
DGCR8Q8WYQ5 SLCO4A1-204ENST00000466818 556 ntTSL 38.57□□□□□ -1.042e-10■■■■■ 91.3
DGCR8Q8WYQ5 ABR-207ENST00000570525 549 ntTSL 416■□□□□ 0.155e-7■■■■■ 91.3
DGCR8Q8WYQ5 DNAH1-201ENST00000420323 13104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.835e-7■■■■■ 91.3
DGCR8Q8WYQ5 DNAH1-204ENST00000486752 13300 ntTSL 27.04□□□□□ -1.285e-7■■■■■ 91.3
DGCR8Q8WYQ5 TPCN2-204ENST00000535009 2175 ntTSL 224.26■■□□□ 1.479e-10■■■■■ 90.9
DGCR8Q8WYQ5 PCCA-208ENST00000458283 669 ntTSL 310.29□□□□□ -0.762e-9■■■■■ 90.9
DGCR8Q8WYQ5 PCCA-204ENST00000413170 397 ntTSL 310.04□□□□□ -0.82e-9■■■■■ 90.9
DGCR8Q8WYQ5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.341e-9■■■■■ 90.9
DGCR8Q8WYQ5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.311e-9■■■■■ 90.9
DGCR8Q8WYQ5 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.181e-9■■■■■ 90.9
DGCR8Q8WYQ5 NR4A3-203ENST00000395097 3794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.321e-9■■■■■ 90.9
DGCR8Q8WYQ5 CHTF8-209ENST00000522497 831 ntTSL 221.7■■□□□ 1.062e-9■■■■■ 90.7
DGCR8Q8WYQ5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.972e-9■■■■■ 90.7
DGCR8Q8WYQ5 CHTF8-211ENST00000567763 734 ntTSL 220.82■□□□□ 0.922e-9■■■■■ 90.7
DGCR8Q8WYQ5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.892e-9■■■■■ 90.7
DGCR8Q8WYQ5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.832e-9■■■■■ 90.7
DGCR8Q8WYQ5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.632e-9■■■■■ 90.7
DGCR8Q8WYQ5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 90.7
DGCR8Q8WYQ5 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.332e-9■■■■■ 90.7
DGCR8Q8WYQ5 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.752e-9■■■■■ 90.7
DGCR8Q8WYQ5 CTDSP1-203ENST00000431127 586 ntTSL 316.61■□□□□ 0.252e-10■■■■■ 90.6
DGCR8Q8WYQ5 C9orf3-207ENST00000445181 873 ntTSL 322.89■■□□□ 1.254e-7■■■■■ 90.5
DGCR8Q8WYQ5 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 04e-7■■■■■ 90.4
DGCR8Q8WYQ5 NCOR2-213ENST00000448614 582 ntTSL 314.04□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 90.2
DGCR8Q8WYQ5 C9orf3-221ENST00000489562 646 ntTSL 213.97□□□□□ -0.174e-7■■■■■ 90.2
DGCR8Q8WYQ5 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.525e-7■■■■■ 90
DGCR8Q8WYQ5 BCAR1-213ENST00000563323 558 ntTSL 318.89■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 90
DGCR8Q8WYQ5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.512e-8■■■■■ 90
DGCR8Q8WYQ5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.432e-8■■■■■ 90
DGCR8Q8WYQ5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 90
DGCR8Q8WYQ5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 90
DGCR8Q8WYQ5 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 90
DGCR8Q8WYQ5 ACSF3-211ENST00000540697 829 ntTSL 216.02■□□□□ 0.162e-8■■■■■ 90
DGCR8Q8WYQ5 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 90
DGCR8Q8WYQ5 BCAR1-211ENST00000562556 4659 ntTSL 214.15□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 90
DGCR8Q8WYQ5 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.192e-8■■■■■ 90
DGCR8Q8WYQ5 BCAR1-220ENST00000568864 556 ntTSL 413.33□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 90
Retrieved 100 of 22,183 protein–RNA pairs in 493.9 ms