RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332503.5

HOXB4-201, Transcript of homeobox B4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB4, Length 3,757 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4-201ENST00000332503 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXB4-201ENST00000332503 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
HOXB4-201ENST00000332503 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXB4-201ENST00000332503 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXB4-201ENST00000332503 HRCP23327 699 aa25.77■■□□□ 1.72
HOXB4-201ENST00000332503 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXB4-201ENST00000332503 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXB4-201ENST00000332503 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB4-201ENST00000332503 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
HOXB4-201ENST00000332503 ABCC9O60706 1549 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXB4-201ENST00000332503 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXB4-201ENST00000332503 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXB4-201ENST00000332503 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXB4-201ENST00000332503 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXB4-201ENST00000332503 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
HOXB4-201ENST00000332503 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
HOXB4-201ENST00000332503 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXB4-201ENST00000332503 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
HOXB4-201ENST00000332503 SCRIBQ14160 1630 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB4-201ENST00000332503 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXB4-201ENST00000332503 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXB4-201ENST00000332503 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
HOXB4-201ENST00000332503 NACADO15069 1562 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB4-201ENST00000332503 WIZO95785 1651 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB4-201ENST00000332503 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB4-201ENST00000332503 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.41
HOXB4-201ENST00000332503 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXB4-201ENST00000332503 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB4-201ENST00000332503 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
HOXB4-201ENST00000332503 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB4-201ENST00000332503 TRIM41Q8WV44 630 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB4-201ENST00000332503 SMARCA2P51531 1590 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB4-201ENST00000332503 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
HOXB4-201ENST00000332503 NEUROD1Q13562 356 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB4-201ENST00000332503 SMARCA4P51532 1647 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB4-201ENST00000332503 ABCC8Q09428 1581 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB4-201ENST00000332503 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB4-201ENST00000332503 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXB4-201ENST00000332503 KIF21BO75037 1637 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXB4-201ENST00000332503 CEP162Q5TB80 1403 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB4-201ENST00000332503 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB4-201ENST00000332503 EEA1Q15075 1411 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB4-201ENST00000332503 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
HOXB4-201ENST00000332503 SOGA1O94964 1423 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB4-201ENST00000332503 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB4-201ENST00000332503 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXB4-201ENST00000332503 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXB4-201ENST00000332503 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXB4-201ENST00000332503 SYNJ1O43426 1573 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXB4-201ENST00000332503 MYT1Q01538 1121 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB4-201ENST00000332503 GOLGA3Q08378 1498 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB4-201ENST00000332503 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB4-201ENST00000332503 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXB4-201ENST00000332503 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXB4-201ENST00000332503 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
HOXB4-201ENST00000332503 CUX2O14529 1486 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXB4-201ENST00000332503 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXB4-201ENST00000332503 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB4-201ENST00000332503 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
HOXB4-201ENST00000332503 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXB4-201ENST00000332503 TOP2BQ02880 1626 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB4-201ENST00000332503 CLIP1P30622 1438 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB4-201ENST00000332503 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXB4-201ENST00000332503 MIER1Q8N108 512 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB4-201ENST00000332503 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB4-201ENST00000332503 ARAP1Q96P48 1450 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXB4-201ENST00000332503 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXB4-201ENST00000332503 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB4-201ENST00000332503 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXB4-201ENST00000332503 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
HOXB4-201ENST00000332503 PRXQ9BXM0 1461 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB4-201ENST00000332503 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB4-201ENST00000332503 PRDM2Q13029 1718 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB4-201ENST00000332503 MAPKBP1O60336 1514 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXB4-201ENST00000332503 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXB4-201ENST00000332503 MAP3K1Q13233 1512 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB4-201ENST00000332503 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB4-201ENST00000332503 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXB4-201ENST00000332503 CUX1P39880 1505 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXB4-201ENST00000332503 HMGXB3Q12766 1538 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB4-201ENST00000332503 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB4-201ENST00000332503 TIAM1Q13009 1591 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB4-201ENST00000332503 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB4-201ENST00000332503 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB4-201ENST00000332503 WDR97A6NE52 1622 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB4-201ENST00000332503 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
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HOXB4-201ENST00000332503 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
HOXB4-201ENST00000332503 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXB4-201ENST00000332503 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXB4-201ENST00000332503 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXB4-201ENST00000332503 CFTRP13569 1480 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXB4-201ENST00000332503 NCAPD3P42695 1498 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXB4-201ENST00000332503 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXB4-201ENST00000332503 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXB4-201ENST00000332503 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
HOXB4-201ENST00000332503 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
HOXB4-201ENST00000332503 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXB4-201ENST00000332503 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
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