Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATRIPQ8WXE1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms