Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLGN4YQ8NFZ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLGN4YQ8NFZ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLGN4YQ8NFZ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms