Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARMIL3Q8ND23 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CARMIL3Q8ND23 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL3Q8ND23 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL3Q8ND23 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL3Q8ND23 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL3Q8ND23 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL3Q8ND23 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL3Q8ND23 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL3Q8ND23 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL3Q8ND23 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL3Q8ND23 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL3Q8ND23 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL3Q8ND23 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL3Q8ND23 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL3Q8ND23 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL3Q8ND23 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL3Q8ND23 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARMIL3Q8ND23 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARMIL3Q8ND23 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms