Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LINC00301Q8NCQ3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LINC00301Q8NCQ3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms