Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBBP6Q7Z6E9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.58■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.3 ms