Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MUC6Q6W4X9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MUC6Q6W4X9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MUC6Q6W4X9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MUC6Q6W4X9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MUC6Q6W4X9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MUC6Q6W4X9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MUC6Q6W4X9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MUC6Q6W4X9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MUC6Q6W4X9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MUC6Q6W4X9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MUC6Q6W4X9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MUC6Q6W4X9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MUC6Q6W4X9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MUC6Q6W4X9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MUC6Q6W4X9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MUC6Q6W4X9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MUC6Q6W4X9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MUC6Q6W4X9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MUC6Q6W4X9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MUC6Q6W4X9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MUC6Q6W4X9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MUC6Q6W4X9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC6Q6W4X9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC6Q6W4X9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC6Q6W4X9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC6Q6W4X9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC6Q6W4X9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC6Q6W4X9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MUC6Q6W4X9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MUC6Q6W4X9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms