Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRIP3Q6Q6R5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRIP3Q6Q6R5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRIP3Q6Q6R5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.9 ms