Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED27Q6P2C8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MED27Q6P2C8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms