Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.19■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RPRD2Q5VT52 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
RPRD2Q5VT52 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RPRD2Q5VT52 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RPRD2Q5VT52 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RPRD2Q5VT52 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RPRD2Q5VT52 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
RPRD2Q5VT52 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
RPRD2Q5VT52 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
RPRD2Q5VT52 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
RPRD2Q5VT52 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RPRD2Q5VT52 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RPRD2Q5VT52 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RPRD2Q5VT52 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RPRD2Q5VT52 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms