Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ODF2Q5BJF6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms