Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PAN3Q58A45 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms