Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ESCO2Q56NI9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ESCO2Q56NI9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms