Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
COBLL1Q53SF7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COBLL1Q53SF7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COBLL1Q53SF7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms