Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF4Q2M2E3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF4Q2M2E3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF4Q2M2E3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF4Q2M2E3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF4Q2M2E3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF4Q2M2E3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF4Q2M2E3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF4Q2M2E3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF4Q2M2E3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF4Q2M2E3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF4Q2M2E3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF4Q2M2E3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF4Q2M2E3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF4Q2M2E3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF4Q2M2E3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF4Q2M2E3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF4Q2M2E3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF4Q2M2E3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF4Q2M2E3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms