Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMA3Q16787 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMA3Q16787 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
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