Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRR4Q16378 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PRR4Q16378 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRR4Q16378 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRR4Q16378 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRR4Q16378 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRR4Q16378 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PRR4Q16378 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRR4Q16378 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRR4Q16378 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRR4Q16378 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRR4Q16378 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRR4Q16378 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRR4Q16378 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRR4Q16378 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRR4Q16378 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRR4Q16378 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRR4Q16378 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms