Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZIC1Q15915 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms