Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD1Q15797 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
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