Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TAF1CQ15572 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TAF1CQ15572 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TAF1CQ15572 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TAF1CQ15572 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TAF1CQ15572 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TAF1CQ15572 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1CQ15572 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1CQ15572 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1CQ15572 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1CQ15572 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1CQ15572 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TAF1CQ15572 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1CQ15572 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1CQ15572 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1CQ15572 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TAF1CQ15572 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TAF1CQ15572 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TAF1CQ15572 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TAF1CQ15572 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TAF1CQ15572 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TAF1CQ15572 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TAF1CQ15572 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TAF1CQ15572 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TAF1CQ15572 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TAF1CQ15572 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TAF1CQ15572 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TAF1CQ15572 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TAF1CQ15572 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
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