Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKD1Q15139 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKD1Q15139 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKD1Q15139 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKD1Q15139 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKD1Q15139 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKD1Q15139 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKD1Q15139 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKD1Q15139 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKD1Q15139 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKD1Q15139 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKD1Q15139 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKD1Q15139 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKD1Q15139 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKD1Q15139 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKD1Q15139 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKD1Q15139 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKD1Q15139 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
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