Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
EEA1Q15075 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
EEA1Q15075 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
EEA1Q15075 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
EEA1Q15075 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
EEA1Q15075 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
EEA1Q15075 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
EEA1Q15075 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
EEA1Q15075 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
EEA1Q15075 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
EEA1Q15075 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
EEA1Q15075 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
EEA1Q15075 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
EEA1Q15075 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
EEA1Q15075 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
EEA1Q15075 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
EEA1Q15075 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
EEA1Q15075 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
EEA1Q15075 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
EEA1Q15075 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
EEA1Q15075 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
EEA1Q15075 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
EEA1Q15075 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
EEA1Q15075 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
EEA1Q15075 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
EEA1Q15075 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
EEA1Q15075 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
EEA1Q15075 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
EEA1Q15075 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
EEA1Q15075 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
EEA1Q15075 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
EEA1Q15075 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC39.15■■■■□ 3.86
EEA1Q15075 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
EEA1Q15075 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
EEA1Q15075 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
EEA1Q15075 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
EEA1Q15075 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
EEA1Q15075 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC39.14■■■■□ 3.86
EEA1Q15075 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
EEA1Q15075 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
EEA1Q15075 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
EEA1Q15075 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
EEA1Q15075 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
EEA1Q15075 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.86
EEA1Q15075 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
EEA1Q15075 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC39.1■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
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