Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KARSQ15046 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KARSQ15046 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KARSQ15046 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KARSQ15046 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KARSQ15046 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KARSQ15046 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KARSQ15046 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KARSQ15046 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
KARSQ15046 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KARSQ15046 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KARSQ15046 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KARSQ15046 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KARSQ15046 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KARSQ15046 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KARSQ15046 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KARSQ15046 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KARSQ15046 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KARSQ15046 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KARSQ15046 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KARSQ15046 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KARSQ15046 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KARSQ15046 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KARSQ15046 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KARSQ15046 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KARSQ15046 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KARSQ15046 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KARSQ15046 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KARSQ15046 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KARSQ15046 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KARSQ15046 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KARSQ15046 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KARSQ15046 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KARSQ15046 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KARSQ15046 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KARSQ15046 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KARSQ15046 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KARSQ15046 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KARSQ15046 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KARSQ15046 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KARSQ15046 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KARSQ15046 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KARSQ15046 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KARSQ15046 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KARSQ15046 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KARSQ15046 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KARSQ15046 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KARSQ15046 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KARSQ15046 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KARSQ15046 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KARSQ15046 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KARSQ15046 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KARSQ15046 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KARSQ15046 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KARSQ15046 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KARSQ15046 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KARSQ15046 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KARSQ15046 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KARSQ15046 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KARSQ15046 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KARSQ15046 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KARSQ15046 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KARSQ15046 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KARSQ15046 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KARSQ15046 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KARSQ15046 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KARSQ15046 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KARSQ15046 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KARSQ15046 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KARSQ15046 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KARSQ15046 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KARSQ15046 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KARSQ15046 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KARSQ15046 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KARSQ15046 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KARSQ15046 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KARSQ15046 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KARSQ15046 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KARSQ15046 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KARSQ15046 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KARSQ15046 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KARSQ15046 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KARSQ15046 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KARSQ15046 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KARSQ15046 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KARSQ15046 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KARSQ15046 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KARSQ15046 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KARSQ15046 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KARSQ15046 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KARSQ15046 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KARSQ15046 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KARSQ15046 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KARSQ15046 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KARSQ15046 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KARSQ15046 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KARSQ15046 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KARSQ15046 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KARSQ15046 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KARSQ15046 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
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