Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSME4Q14997 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PSME4Q14997 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms