Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAT1Q14517 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms