Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SHROOM2Q13796 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
SHROOM2Q13796 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SHROOM2Q13796 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SHROOM2Q13796 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
SHROOM2Q13796 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SHROOM2Q13796 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
SHROOM2Q13796 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
SHROOM2Q13796 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
SHROOM2Q13796 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
SHROOM2Q13796 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
SHROOM2Q13796 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SHROOM2Q13796 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SHROOM2Q13796 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC38.7■■■■□ 3.79
SHROOM2Q13796 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
SHROOM2Q13796 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
SHROOM2Q13796 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.62■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC38.57■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
SHROOM2Q13796 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
SHROOM2Q13796 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
SHROOM2Q13796 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
SHROOM2Q13796 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
SHROOM2Q13796 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
SHROOM2Q13796 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
SHROOM2Q13796 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
SHROOM2Q13796 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
SHROOM2Q13796 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SHROOM2Q13796 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
SHROOM2Q13796 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
SHROOM2Q13796 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
SHROOM2Q13796 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
SHROOM2Q13796 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
SHROOM2Q13796 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
SHROOM2Q13796 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
SHROOM2Q13796 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SHROOM2Q13796 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
SHROOM2Q13796 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
SHROOM2Q13796 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
SHROOM2Q13796 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SHROOM2Q13796 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
SHROOM2Q13796 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
SHROOM2Q13796 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
SHROOM2Q13796 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
SHROOM2Q13796 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
SHROOM2Q13796 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SHROOM2Q13796 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SHROOM2Q13796 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
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