Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRSF5Q13243 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
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