Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERCC8Q13216 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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ERCC8Q13216 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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