Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDR2Q01850 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.9 ms