Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF2IP78347 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF2IP78347 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF2IP78347 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF2IP78347 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF2IP78347 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF2IP78347 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF2IP78347 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF2IP78347 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF2IP78347 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF2IP78347 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF2IP78347 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF2IP78347 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF2IP78347 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF2IP78347 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF2IP78347 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF2IP78347 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF2IP78347 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF2IP78347 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
GTF2IP78347 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF2IP78347 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF2IP78347 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF2IP78347 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF2IP78347 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF2IP78347 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF2IP78347 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF2IP78347 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF2IP78347 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF2IP78347 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF2IP78347 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF2IP78347 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF2IP78347 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF2IP78347 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF2IP78347 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF2IP78347 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF2IP78347 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF2IP78347 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF2IP78347 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF2IP78347 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF2IP78347 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF2IP78347 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF2IP78347 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms