Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPZ1P61923 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms