Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PROK1P58294 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PROK1P58294 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PROK1P58294 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PROK1P58294 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PROK1P58294 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PROK1P58294 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PROK1P58294 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PROK1P58294 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PROK1P58294 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PROK1P58294 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PROK1P58294 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PROK1P58294 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PROK1P58294 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PROK1P58294 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PROK1P58294 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PROK1P58294 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PROK1P58294 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PROK1P58294 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PROK1P58294 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PROK1P58294 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PROK1P58294 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PROK1P58294 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PROK1P58294 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PROK1P58294 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PROK1P58294 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PROK1P58294 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PROK1P58294 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PROK1P58294 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PROK1P58294 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PROK1P58294 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PROK1P58294 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PROK1P58294 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PROK1P58294 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PROK1P58294 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PROK1P58294 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PROK1P58294 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PROK1P58294 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PROK1P58294 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PROK1P58294 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PROK1P58294 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PROK1P58294 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PROK1P58294 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PROK1P58294 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PROK1P58294 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PROK1P58294 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PROK1P58294 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PROK1P58294 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PROK1P58294 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PROK1P58294 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PROK1P58294 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PROK1P58294 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PROK1P58294 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PROK1P58294 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PROK1P58294 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PROK1P58294 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PROK1P58294 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PROK1P58294 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PROK1P58294 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PROK1P58294 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PROK1P58294 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PROK1P58294 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PROK1P58294 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PROK1P58294 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PROK1P58294 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PROK1P58294 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PROK1P58294 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PROK1P58294 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PROK1P58294 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PROK1P58294 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PROK1P58294 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PROK1P58294 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PROK1P58294 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PROK1P58294 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PROK1P58294 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PROK1P58294 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PROK1P58294 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PROK1P58294 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PROK1P58294 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PROK1P58294 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PROK1P58294 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PROK1P58294 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PROK1P58294 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PROK1P58294 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PROK1P58294 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PROK1P58294 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PROK1P58294 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PROK1P58294 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PROK1P58294 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PROK1P58294 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PROK1P58294 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PROK1P58294 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PROK1P58294 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PROK1P58294 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PROK1P58294 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PROK1P58294 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PROK1P58294 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PROK1P58294 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PROK1P58294 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PROK1P58294 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms