Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP3M2P53677 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP3M2P53677 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms