Protein–RNA interactions for Protein: P49682

CXCR3, C-X-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR3P49682 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCR3P49682 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms